مسجد حیدر با مساحت 12000 متر مربعی برای اولین بار در تاریخ بیست و ششم دسامبر سال 2014 درب های خود را گشود. مساحت ساختمان داخلی مسجد 4200 متر مربع می باشد و نمای آن با سنگ هایی خاص و متاثر از سبک معماری شیروان آبشوران مزین گردیده. برای آن 4 مناره 95 متری، یک گنبد 55 متری و یک گنبد 35 متری در نظر گرفته شده است. در هر دو طرف گنبدها نوشته هایی از آیات مقدس قرآن نیز به چشم می خورد. دفتر مسلمان قفاز امام حافیظ عباس اف (Imam Hafiz Abbasov) را به عنوان پیشوای سنی ها و آخوند روفِت گارایف (Akhund Rufet Garayev) را برای شیعه ها برگزیده. بر اساس گفته های رئیس کمیته دولتی انجمن های مذهبی جمهوری آذربایجان مسجد حیدر مجتمعی مجزاست که ساختمانش به نیروی اجرایی شهر باکو متصل شده و بر اساس قوانین مربوط به آن مدیریت می شود.